بر اساس رتبه بندی و ارزیابی درون دانشگاهی (کیفی) مراکز تحقیقاتی دانشگاه علوم پزشکی اصفهان در سال 1403، از 43 مرکز تحقیقاتی دانشگاه، تعداد ۹ مرکز در رده Q1، ۲۲ مرکز در رده Q2، 9 مرکز در رده Q3 و ۳ مرکز در ردیف Q4قرار گرفتند.
در این رتبه بندی، در رده Q1 مرکز تحقیقات قلب و عروق رتبه 97 و مرکز تحقیقات بازتوانی قلبی رتبه 81 را بدست آوردند. شایان ذکر است مرکز تحقیقات قلب و عروق رتبه اول را در بین مراکز تحقیقاتی دانشگاه کسب نمود.